Novembre 2002 - n°72
Les biotechnologies, au cœur du Département
Santé Animale du Laboratoire Départemental Frank DUNCOMBE
En juin dernier, nous vous dressions un portrait panoramique du Laboratoire
Départemental Frank DUNCOMBE et de ses activités, au service du
Calvados (14) et de ses habitants depuis plus d’un siècle. C’est
pour présenter plus précisément le Département Santé
Animale que son responsable, M. Guillaume FORTIER, nous a aujourd’hui
fixé rendez-vous.
40 personnes à temps plein, une vingtaine de stagiaires chaque année,
1400 m2 dont près de 200 m2 flambant neufs, dédiés à
la biologie moléculaire, 4 zones confinées P2+ d’ambiance
et d’accès contrôlés, 200 000 prélèvements
traités, soit plus de 600 000 analyses réalisées chaque
année : tels sont les chiffes clés du Département Santé
Animale.
Suivons le guide…
Veaux, vaches, cochons, couvées…
chevaux et moutons !
Premiers coups d’œil et première réflexion: ici le
cheval est roi !
Les photos et posters, particulièrement nombreux sur les murs, ne laissent
aucun doute ! M. FORTIER confirme et souligne que les plus grands cracks des
courses hippiques ou encore de l’obstacle sont passés entre les
mains de son équipe. " C’est le cas notamment de plus
de la moitié des vainqueurs du Prix d’Amérique ",
précise-t-il. " Notre laboratoire est probablement le seul laboratoire
départemental à être doté d’un service Hématologie
– Biochimie dédié à la race équine…
"
Fort de cette renommée, le Laboratoire Franck DUNCOMBE s’impose
comme l’un des meilleurs spécialistes du cheval, en France et en
Europe. Mais son champ d’expertise est loin de se limiter au monde équin.
La filière bovine, très fortement représentée dans
le Calvados, ainsi que les marchés porcins et ovins sont également
au cœur de ses prestations.
40 personnes travaillent à temps plein au sein du Département
Santé Animale. Trois vétérinaires, un biologiste moléculaire
et un biologiste universitaire en coordonnent les activités, structurées
autour de 4 services :
- Biochimie, Hématologie, Immunologie, Virologie - Biotechnologies
- Microbiologie - ESB, Parasitologie, Autopsie, Milieux de culture
- Secrétariat Technique
- Recherche & Développement
Le Laboratoire Départemental Franck DUNCOMBE possède d’ailleurs
le statut de laboratoire de tutelle pour la formation des doctorants normands.
Il accueille ainsi en permanence plusieurs thésards dont deux dans son
seul service R&D de Santé Animale.
" Un rôle d’encadrement et de formation auquel nous attachons
une grande importance , au côté d’équipes universitaires
Caennaises toujours très accueillantes et motivées par nos travaux
", souligne M. FORTIER. " notre laboratoire reçoit
chaque année des étudiants en 3ème cycle universitaire,
mais également une vingtaine de stagiaires de tous niveaux. Cotoyer ces
équipes est pour nous un privilège dont nous mesurons régulièrement
les effets "
Quand « Prestation Analytique «
rime avec " Santé Publique "
Contemporains de la création du Laboratoire (1897), les deux pôles
analytiques du Département Santé Animale ont vu leurs activités
s’enrichir au fil des décennies et de l’émergence
de nouvelles technologies. Ils assurent aujourd’hui en routine plus de
600 000 déterminations analytiques par an, soit le double de ce qu’ils
réalisaient il y a 7 ans.
Le service Immunologie – Hématologie – Biochimie –
Cytologie – Virologie – Biologie Moléculaire est placée
sous la direction de Marie-Françoise LEGENDRE ; le service Microbiologie
– ESB - Parasitologie – Autopsie - Milieux de Culture, sous la responsabilité
de Mme Karine MAILLARD.
Soulignons que l’unité de Biologie Moléculaire, fondée
en 1996 après transfert des premières méthodes développées
en R&D, vient d’intégrer de nouveaux locaux : 200 m2
classés P2+, spécifiquement conçus pour le développement
de ce type d’activités dans le cadre d’une extension globale
de 1300 m2.
D’importants investissements matériels (à hauteur de 230
000 euros) ont également été réalisés. 9
thermocycleurs, 2 PCR quantitatives en temps réel, une caméra
de lecture DGL ainsi qu’une chaîne d’extraction ARN/ADN permettent
au Laboratoire de répondre à une sollicitation de plus en plus
forte tout en fiabilisant les différentes étapes d’analyses.
" Nous réalisons aujourd’hui cinq fois plus d’extractions
d’ADN/ARN qu’il y a un an ", nous explique M. FORTIER.
" L’automatisation de nos analyses, notamment grâce à
l’acquisition d’une chaîne d’extraction ARN/ADN, s’imposait,
d’autant plus que nous venons d’engager en routine une nouvelle
prestation de grande ampleur : les analyses de génotypage pour les béliers
vis à vis de la tremblant. Je tiens d’ailleurs à souligner
la collaboration remarquable menée dans ce domaine avec l’Etablissement
Public des Laboratoires Départementaux des Pyrénées Atlantiques
et de l’équipe de Mme Valogne en ce domaine", poursuit
M. FORTIER. «Grâce à un transfert de technologie efficace
et de nombreux échanges, nous avons en effet pu obtenir l’agrément
ministériel début mai 2002 et commencer les analyses dès
la semaine suivante…»
Rappelons que le Laboratoire Départemental Frank DUNCOMBE est régi
depuis plus de 7 ans par une politique qualité rigoureuse et est l’une
des structures analytiques à pouvoir se prévaloir à la
fois d’accréditations COFRAC et d’agréments ministériels
sur tous ses domaines d’expertise. Depuis 1996, le Département
Santé Animale est en effet accrédité pour trois programmes
: Immuno-sérologie animale (109), Virologie animale (112), Microbiologie
animale (116), et possède en parallèle 6 agréments du Ministère
de l’Agriculture.
Des centaines de clients privés - vétérinaires, éleveurs,
particuliers… -, mais aussi les services du Conseil Général
et de l’Etat (Direction des Services Vétérinaires, DDCCRF,
DRIRE…), ou encore, des organismes d’intérêt public
tels que le Groupement de Défense Sanitaire (GDS), syndicats ou fédérations
d’éleveurs font aujourd’hui confiance à l’équipe
Santé Animale du Laboratoire Frank DUNCOMBE.
Savoir-faire et faire savoir : les maîtres
mots d’une R&D particulièrement dynamique
" En 1995, notre laboratoire a été le premier laboratoire
départemental à se doter d’une structure de recherche appliquée
", déclare M. Stéphane PRONOST, responsable du service
R&D du Département Santé Animale.
M. FORTIER, à l’origine de cette initiative, avait effectivement
très tôt perçu l’intérêt de la biologie
moléculaire pour le diagnostic vétérinaire ; "
nous nous sommes rapidement heurtés au manque de kits vétérinaires
disponibles sur le marché concernant nos domaines de prédilection
", souligne-t-il. " Il nous a donc semblé indispensable
de nous doter en interne d’un outil de biologie moléculaire qui
nous permette de nous affranchir totalement de ces difficultés d’approvisionnement,
tout en nous ouvrant la possibilité de mettre au point, valider et optimiser
des méthodes précisément adaptées à nos besoins…
"
La mission du service R&D est donc de développer dans les meilleurs
délais des méthodes de diagnostic rapides, fiables et économiquement
concevables, qui seront ensuite transférées dans les unités
techniques du Laboratoire. Au cœur des projets mis en œuvre : l’hématologie
et la biochimie, centrées sur l’optimisation des performances du
cheval et du poulain, et, bien évidemment, les biotechnologies.
Notons d’ailleurs que, contre toute attente, ce n’est ni sur les
équidés, ni sur les bovidés que le Laboratoire a engagé
ses premiers travaux en biotechnologie, mais sur la race porcine. "
Les premières études PCR ont en effet concerné la détection
de certaines bactéries intestinales du porc ", nous explique
Stéphane PRONOST. « En trois mois, une technique a pu être
validée et transférée auprès de laboratoires bretons…».
Depuis, le nombre de PCR réalisées à l’année
par le Laboratoire Frank DUNCOMBE a été multiplié par 100.
PCR classique, RT-PCR, nested-PCR, PCR quantitative ou SNP-PCR: 17 méthodes,
mises au point en interne, sont aujourd’hui utilisées en routine,
tandis qu’une dizaine d’autres sont en cours de développement.
Des études conduites en partenariat avec
d’autres équipes de recherche
" Les synergies mises en œuvre avec des spécialistes en
médecine vétérinaire et en santé humaine sont primordiales
", affirme M. FORTIER. L’AFSSA Dozulé, l’Université
de Caen (virologie, parasitologie, immunologie, hormonologie, bactériologie…),
les écoles vétérinaires, au même titre que le CHU
de Nantes et l’Institut de Puériculture de Paris sont aujourd’hui
au cœur du réseau de compétences du Laboratoire normand.
" Notre collaboration avec l’AFSSA Dozulé fait d’ailleurs
aujourd’hui l’objet d’un accord officiel : une Convention
de Partenariat Total ", ajoute M. FORTIER. " De même,
il est important de souligner la continuité et le succès des relations
engagées il y a plusieurs années avec ADIAGENE, start-up bretonne
spécialiste de la biologie moléculaire appliquée au diagnostic
vétérinaire ".
- Le partenariat a débuté dans le cadre de la mise au point,
par ADIAGENE, d’une méthode PCR visant au diagnostic de la paratuberculose
chez les bovins. " La technique est cinquante fois plus rapide que
la méthode de référence, tout en garantissant les mêmes
spécificité et sensibilité ", précise
Stéphane PRONOST. Outre cette technique de PCR classique, validée
et utilisée en routine depuis un an au LDFD14, c’est la deuxième
génération du kit ADIAGENE utilisant la PCR en temps réel,
que l’équipe de M. FORTIER valide aujourd’hui dans ses locaux.
- Parallèlement, un travail identique a été initié
sur le BVD (virus bovin de la diarrhée virale). Le test PCR classique
utilisé aujourd’hui au Laboratoire Départemental Frank Duncombe
sera peut-être remplacé demain par un test de PCR temps réel.
A l’exemple de ces développements intéressants en termes
de fiabilité, de sensibilité, de rapidité d’analyses
et de coût, de nombreux autres projets sont à l’étude,
dont trois en cours de validation dans le domaine des pathologies virales et
parasitaires du cheval. Les objectifs pour l’année 2003 : de nouveaux
programmes d’investissement matériel et la mise en œuvre d’un
module supplémentaire de biologie moléculaire…
N’hésitez pas à contacter le Laboratoire Départemental
Frank DUNCOMBE pour en savoir plus…