Avril 2003 - n°77
GENSODI DEVELOPPE UN OUTIL DE CRIBLAGE ET D’AIDE
A LA THERAPIE
Une molécule sur dix, au moins, pourtant efficace in vitro,
n’est pas testée en phase clinique sur l’homme car elle
s’est révélée toxique chez l’animal…
Si ces molécules à risque étaient détectées
plus tôt, c’est-à-dire avant les essais in vivo, les entreprises
pharmaceutiques feraient alors des économies et épargneraient
bien des vies animales…
C’est sur ce constat que l’équipe de GENSODI a créé
un outil révolutionnaire appelé PredictSearch, basé sur
la technologie des puces à ADN. Outre son utilisation comme outil de
“ criblage ” pour tester l’activité ou la cytotoxicité
de nouvelles molécules, il sera appliqué dans divers domaines
thérapeutiques : la dermatologie, l’allergologie, la cancérologie…
A l’origine, Philippe BENECH, Directeur de recherche au CNRS a mis en
place au sein du campus de Luminy, un laboratoire nommé IMVT (Innovation
Moléculaire pour la Valorisation et le Transfert), dédié
à la recherche appliquée dans le domaine de la génomique
fonctionnelle. Fort de cette expérience, il décide de transférer
cette activité dans le domaine privé et fonde la société
GENSODI -en cours de création- dont l’objectif est de développer
des prototypes (outils moléculaires et instrumentation) à partir
de résultats scientifiques issus des laboratoires académiques
ou d’une R & D réalisée en interne.
Le premier grand projet initié, PredictSearch est
basé sur la technologie des puces à ADN qui consiste à
soumettre un grand nombre de gènes -préalablement immobilisés
sur un support- à un matériel biologique issu de lignées
cellulaires ou de tissus. Le signal obtenu permet de quantifier l’expression
individuelle des produits d’expression. L’évaluation économique
et technologique des secteurs d’application ont conduit GenSodi à
définir un outil de criblage d’activités biologiques et
d’aide à l’évaluation thérapeutique.
Pour en arriver là, les chercheurs sélectionnent par informatique
des séquences de gènes (ADN) activables par les médiateurs
des réactions immunitaires et de l’inflammation (les ”
cytokines ”). Ils ont ensuite immobilisé ces petits morceaux
d’ADN, qui servent alors de sondes sur la bio-puce. Ceux-ci s’associent
(“s’hybrident ”) avec les séquences complémentaires
d’ARN de l’échantillon biologique analysé. Il est
ainsi possible de quantifier l’expression d’un ensemble de gènes,
reflétant une toxicité par exemple. Or dans l’organisme,
les cellules sont exposées simultanément à de nombreuses
cytokines. La réponse immunitaire de l’échantillon dépend
à la fois des concentrations des cytokines et du type cellulaire analysé.
Cette technologie permet par ailleurs de prédire au moyen d’une
seule analyse, l’activité d’un composé sur les gènes
impliqués dans des processus divers comme la mort cellulaire, la différenciation
de cellules souches ou l’activation des cellules lymphocytaires.
La première approche de GenSodi a consisté à identifier
une collection de 3 500 gènes humains et 1 400 gènes souris
présentant comme déterminant commun d’être inductibles
par des molécules telles que les cytokines et certains facteurs de
croissance. Cette collection servira de base à la production d’une
puce dédiée aux processus inflammatoires associée à
une base de données permettant l’identification de réseaux
fonctionnels. Une déclinaison de ce produit sous la forme d’un
kit PCR temps réel et d’une puce anti-corps est prévue.
Les marchés visés sont les “ Big Pharma ” (outil
de criblage) et les laboratoires cliniques (évaluation thérapeutique).
Sur un autre plan, GenSodi a développé une gamme d’instrumentation
appelée “ Tek-IT-easy ” dont la philosophie réside
dans la simplicité d’utilisation et le faible coût. Cette
gamme comprend à l’heure actuelle 4 produits couverts par des
brevets :
- le MacPid est une cuve d’électrophorèse
dédiée au haut débit intégrant une analyse qualitative
et quantitative automatisée des dépôts (ne requérant
pas l’utilisation de BET, ni de chambre noire),
- le SwingRunner correspond à un accessoire adapté
au MacPid qui élimine les aspects fastidieux du dépôt
manuel pour des laboratoires qui n’ont pas accès à des
automates.
- le DiskCloser répond au besoin crucial de déposer
ou de prélever des échantillons de manière aisée
et automatisée à partir de plaques de micro-titration sans risque
de contamination d’un puit par l’autre,
- le MakomSafe, utilisant la technologie du DiskCloser, correspond
à une mini-salle blanche intégrée à une plate-forme
automatisée.
GenSodi est lauréat du concours MRT pour la création d’entreprises
innovantes 2002 et récemment pour les “ Tremplins de la Fondation
AVENTIS 2003 ”. Il est aussi le premier projet à être co-incubé
par l’incubateur régional IMPULSE et celui de l’Association
Grand Luminy.
Avec Philippe BENECH, l’équipe de GenSodi est
composée de Jean-Pierre YAMIN, Ingénieur SupElec et Responsable
de l’Instrumentation, de Philippe HALFON, médecin-pharmacien
biologiste et responsable du secteur clinique, de Frédéric FOUCAULT,
biologiste moléculaire, de Jean-Philippe ALIMI, assistant ingénieur,
et de Lionel EDOUARD charge des aspects administratifs et de marketing.
Les espaces bureau sont situés dans l’incubateur “ Grand
Luminy ”. Le laboratoire a une surface de 100 m2 équipée
du matériel requis pour la biologie moléculaire (centrifugeuse
de paillasse et centrifugeuse réfrigérée de grande capacité,
four à hybridation, hotte à flux laminiaire, étuve à
CO2, incubateur et agitateur bactério, matériel d’électrophorèse,
électroporateur, et un ensemble de stockage à froid +4°
C, -20° C et –80° C). De plus, un accord contractuel avec l’Inserm
et le CNRS lui permet d’avoir accès à de l’équipement
lourd (automates, spotter, scanner) localisé au sein de deux plates-formes
technologiques.
Dans le cadre de ses activités, GenSodi a passé un accord avec
la société suisse d’instrumentation TECAN et avec la société
Ozyme (développement du MacPid) mais aussi un partenariat avec une
PME : BET Analyses (activité de sous-traitance pour la réalisation
de profil d’expression dans le domaine de la dermatologie).
Dans l’avenir, GenSodi compte rapidement étoffer l’équipe
par le recrutement de biologistes moléculaires, de bio-informaticiens
et d’informaticiens. Au sein de la gamme “ Tek-IT-easy ”,
les produits MacPid, SwingRunner et DiskCloser devraient être opérationnels
courant 2004. Plusieurs projets de prestation de service sont en cours de
négociation. D’autres programmes de R&D vont être engagés
afin d’être en mesure de présenter de nouveaux produits
dès 2006.
MH
Contact :
GenSodi
Dr. Philippe BENECH
Directeur scientifique d’IMVT