Avril 2007 - n°120

L’Unité EA 3175 de l’Université de Limoges

Créée en 2000, l’équipe « Biologie cellulaire et Moléculaire des Microorganismes » (EA 3175 étudie les mécanismes moléculaires des résistances aux antimicrobiens, antibiotiques et antiviraux.

Les travaux de l'EA 3175 se sont focalisés sur l'étude de la diversité des souches bactériennes et virales résistantes, dans le but de mieux comprendre l'évolution d'acquisition de la résistance au sein des génomes microbiens et de la cinétique d'émergence des résistances.

Comprendre les mécanismes de résistance des bactéries

Après plusieurs décennies « d’euphorie » consécutives à la découverte des premiers antibiotiques tels que la pénicilline ou les sulfamides, nous connaissons aujourd’hui une période plus critique avec l’augmentation de la résistance des bactéries à de nombreux antibiotiques. Le monde viral n’échappe pas à cette règle et de nombreux virus ont su s’adapter et résister aux traitements antiviraux. Les cliniciens sont donc confrontés parfois à de véritables impasses thérapeutiques dans la prise en charge des maladies infectieuses bactériennes ou virales.
Cette résistance se fait le plus souvent chez les bactéries par acquisition d’ADN étranger par l’intermédiaire de supports génétiques tels que les plasmides ou les transposons et chez les virus par la survenue de mutations sur les gènes nécessaires à leur métabolisme qui constituent des cibles pour les antiviraux.

Les travaux de l’équipe « Biologie cellulaire et Moléculaire des Microorganismes » sur l’étude des supports moléculaires des résistances aux antimicrobiens se sont orientés autour de deux axes :
- axe épidémiologique : l’étude de la diversité des souches bactériennes et virales résistantes et des polymorphismes de résistance est nécessaire au suivi de l’évolution des résistances acquises au sein des génomes microbiens et à la compréhension de la cinétique d’émergence de ces résistances
- axe mécanistique : les travaux de recherche permettront de mieux comprendre les mécanismes d’acquisition des résistances chez les bactéries et d’identifier les relations structure-activité des antiviraux. Le but étant de développer des médicaments empêchant les bactéries d’acquérir de la résistance ainsi que de nouveaux antiviraux.

l’EA3175 travaille en étroite collaboration sur les antiviraux avec le Centre National de référence du cytomegalovirus de Limoges (créé en 2OO6), dont la directrice est le Dr Sophie Alain..
Par ailleurs, l’EA3175 vient de recevoir un label INSERM sous la forme d’un contrat Avenir attribué au Pr Marie-Cécile Ploy pour les travaux de l’équipe sur la résistance aux antibiotiques.

L’équipe EA 3175, co-dirigée par François Denis et Marie-Cécile Ploy, est composée de 5 doctorants, de deux personnes en Master 2 et d’une technicienne. Les enseignants chercheurs sont au nombre de 7 dont 3 cliniciens. Le laboratoire de recherche s’étend sur 80 m² au sein de la Faculté de Médecine de Limoges. Le matériel utilisé concerne la biologie moléculaire (PCR, centrifugeuses...). A partir de juin 2007, l’équipe va intégrer de nouveaux locaux d’environ 200 m² en cours de construction.

L’EA 3175 a développé des collaborations d’une part avec l’équipe “Unité de plasticité du génome bactérien” de l’Institut Pasteur et d’autre part, avec le Département de “Pharmacologie chimique et biologique” de la Faculté de Pharmacie Paris V. En outre, elle a également un partenariat avec le centre de recherche clinique du CHU de Limoges dirigé par le Dr Bruno Fgrançois dans le cadre de plusieurs protocoles de recherche clinique avec des industries pharmaceutiques En collaboration avec l’équipe EA 4021 du Pr Jean-Luc Duroux à Limoges, l’équipe « Biologie cellulaire et Moléculaire des Microorganismes » travaille sur la synthèse de molécules thérapeutiques sur des modèles viraux et bactériens. Par ailleurs, elle étudie la possibilité d’un lien entre l’appareil digestif de l’homme avec celui de l’animal en partenariat avec le Laboratoire Départemental Vétérinaire de Limoges.

Forte de son contrat de 3 ans avec l’Inserm, l’EA 3175 souhaite présenter dans l’avenir un réel projet d’Unité Inserm. A suivre...

M. HASLÉ