Offres d'emploi- ingenieur

Annonce n° : 102710
Date de l'annonce : 07 Fév 2018
INGENIEUR DE RECHERCHE (H/F) DATA SCIENTISTS / MACHINE LEARNING
Localisation : 75015 Paris Ile-de-France France


Coordonnées à utiliser pour répondre à l'annonce :

  Email : recrutement@institutimagine.org
  Tél. : 01 42 75 42 48
Société Institut Imagine
Service
Contact Mme  RESWEBER-GOUIN Emilie
Adresse 24 boulevard du Montparnasse
  75015 PARIS
Pays France

Créé à l’initiative des chercheurs et médecins de l’Hôpital Necker – Enfants malades, l’Institut hospitalo-universitaire (IHU) des maladies génétiques Imagine développe des programmes scientifiques fondés sur une continuité entre recherche fondamentale, recherche clinique et soins innovants sur les maladies génétiques et les prédispositions génétiques aux maladies fréquentes, de l’enfance à l’âge adulte. Cet IHU est porté par l’Institut Imagine, fondation de coopération scientifique ayant pour ambition d’accélérer la recherche en l’organisant au plus près du malade afin d’apporter les solutions diagnostiques et thérapeutiques attendues par les patients et leurs familles.

Dans le cadre du projet RHU C’IL-LICO «Médecine du futur pour les ciliopathies avec atteinte rénale», dont le but est de développer de nouveaux outils diagnostiques et thérapeutiques pour les patients souffrant de ces pathologies, la plateforme «Data Science» est responsable du work package 1 orienté sur l’exploitation des données phénotypiques dont :
• l’intégration des bases de données de recherche, des bases de données cliniques et des bases de connaissances dans un entrepôt de données dédié
• la description complète de l'histoire naturelle des ciliopathies permettant ainsi une nouvelle classification de ces maladies
Ce projet s’appuie entre autres sur l’entrepôt de données de Necker (500 000 patients et 4 millions de comptes rendus hospitaliers) développé par la plateforme data science d’Imagine.
Afin de répondre à ces objectifs, la plateforme « Data Science » de l’Institut Imagine recrute un ingénieur de recherche date scientists / machine learning.

MISSIONS ET FONCTIONS

L’ingénieur travaille sous la responsabilité hiérarchique du responsable de la plateforme.
Il s’agira de réaliser un phénotypage haut débit à partir des données structurées (biologie, données codées) et non structurées (comptes rendus hospitaliers) contenu dans l’entrepôt de données des ciliopathies. L’extraction phénotypique nécessitera d’utiliser des méthodes de machine learning pour reconnaître par exemple les négations, suspicions, etc. et améliorer l’extraction des concepts.
Ces méthodes pourront par ailleurs être généralisées sur l’entrepôt de données de Necker.

COMPETENCES

Connaissances
• Connaissances solides en machine learning
• Connaissances en traitement automatique du langage
• Connaissance du secteur médical appréciée
• Connaissances solides en R ou Python et autonomie sur l’environnement UNIX/LINUX
• Maîtrise du SQL
• Connaissance appréciée des outils de développement utilisant les technologies du web
• Bonne maîtrise de l’anglais

Qualités
• Rigueur, organisation et autonomie indispensables
• Esprit d’équipe
• Esprit curieux
• Polyvalence
• Capacité d’adaptation
• Connaissances sur la sécurité des données, la protection de la vie privée et à l’usage éthique des données

FORMATION
• PhD en biostatistiques, informatique médicale, statistiques, mathématiques.

CONTRAT
• CDD OD de 36 mois

SALAIRE
• Selon l’expérience

MODALITES DU RECRUTEMENT
Le dossier de candidature, comprenant une lettre de motivation et un curriculum vitae, est à adresser, pour le 05/03/2018, au plus tard, sous la référence Imagine_113 à recrutement@institutimagine.org et nicolas.garcelon@institutimagine.org

 
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